在噴霧干燥機中很難干燥含有有機溶劑的材料。一般有機溶劑都是易燃易爆的。防爆封閉實驗室閃蒸干燥機可使物料在封閉干燥系統中循環。整個系統充滿惰性氣體，可以避免有機溶劑氣體與外界氧氣接觸，保證安全生產。

噴霧干燥器采用安全氮氣閉路循環。整個系統處于封閉狀態，在線監測氧氣濃度。一旦系統中的氧氣濃度達到2%，系統將自動關閉并發出警報。安全方便的實驗室有機溶劑小型噴霧干燥機，安全性好，操作簡單。閉路循環氮氣是易燃有毒的溶劑，可回收，易氧化干燥。此外，由于有機溶劑的沸點低，易于熱變性的物質在低溫下干燥。噴霧干燥器噴霧干燥含糖量高或對熱敏感的材料。由于大多數多糖雙糖的熔點相對較低，當加熱時，糖會融化，多糖雙糖本身更容易吸收水分。所以普通噴霧干燥機容易粘壁，不容易獲得好的干粉或顆粒。

另外，常用的噴霧干燥機，如酶制劑、活菌和一些高溫易變性的高分子材料，所以材料容易失活或變性。此時，降低噴霧干燥器的進出口空氣溫度可以獲得良好的實驗結果。